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轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法克隆基因的改進(jìn)
點(diǎn)擊次數(shù):631 更新時間:2016-03-18

ELISA試劑盒1 轉(zhuǎn)座子及轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法克隆基因 
基因標(biāo)簽法克隆植物組織中的基因是較為常用的一種方法,T-DNA和轉(zhuǎn)座子均可作為基因標(biāo)簽。 
轉(zhuǎn)座子zui早由美國的細(xì)胞遺傳學(xué)家Mc-clintock在玉米中發(fā)現(xiàn),它是指基因組中一段特定DNA片段,能在轉(zhuǎn)位酶的作用下從基因組的一個位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個位點(diǎn)。轉(zhuǎn)座子不僅能在本基因組中轉(zhuǎn)座,也能轉(zhuǎn)入其它植物的基因組中。轉(zhuǎn)座的結(jié)果是使被轉(zhuǎn)入的基因失活,從而有效地誘導(dǎo)產(chǎn)生表型突變株。然后構(gòu)建一個對應(yīng)于突變株的基因庫,用作標(biāo)簽的轉(zhuǎn)座子作為探針從基因庫中篩選相對應(yīng)的克隆,分離得到相對應(yīng)于變異的基因,這就是轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽克隆基因。 
玉米的Ac/Ds轉(zhuǎn)座子家族是研究較為深入的植物轉(zhuǎn)座子。 
2 Ac、Ds轉(zhuǎn)座子作基因標(biāo)簽時遇到的問題 
2.1 Ac屬于自主性轉(zhuǎn)座子,自己能編碼轉(zhuǎn)位酶,因此可直接用于基因標(biāo)簽。但是由于Ac能自由地在基因組中轉(zhuǎn)座,結(jié)果使轉(zhuǎn)座產(chǎn)生的變異不穩(wěn)定,給確定和分析突變基因帶來困難。 
2.2 Ds屬非自主性轉(zhuǎn)座子,本身不能編碼轉(zhuǎn)位酶,必須依靠Ac轉(zhuǎn)座子產(chǎn)生的轉(zhuǎn)位酶才能產(chǎn)生轉(zhuǎn)座,因此Ds只有和Ac聯(lián)合使用才能做為基因標(biāo)簽。 
2.3 Ac和Ds聯(lián)合使用后遇到的問題是Ac本身的轉(zhuǎn)座成為除Ds之外又一個轉(zhuǎn)座因素,因此產(chǎn)生突變后,要首先經(jīng)過遺傳分析確定突變因子是哪一個轉(zhuǎn)座子,才能用探針進(jìn)行篩選克隆,這就增加了分離基因的難度和工作量。另外,Ac和Ds同時存在情況下,Ds能在Ac產(chǎn)生的轉(zhuǎn)座酶作用下頻繁轉(zhuǎn)位,難以產(chǎn)生穩(wěn)定的突變,這又產(chǎn)生了與Ac單獨(dú)使用時存在的問題。 
2.4 由以上分析,轉(zhuǎn)座子Ac和Ds聯(lián)合使用時必須從兩方面進(jìn)行改進(jìn):首先,如何使Ac穩(wěn)定下來,即只有產(chǎn)生轉(zhuǎn)位酶的能力而無轉(zhuǎn)座的能力,從而減少產(chǎn)生突變的轉(zhuǎn)座子種類。此外,如何使Ds轉(zhuǎn)座后,將產(chǎn)生轉(zhuǎn)座酶的Ac分離,從而使Ds穩(wěn)定下來,不再轉(zhuǎn)座,使產(chǎn)生的變異得到穩(wěn)定。人們對Ac、Ds進(jìn)行改進(jìn)后,發(fā)展了一種稱為sAc/Ds的雙系統(tǒng)法。 
3 sAc/Ds雙系統(tǒng)法 
3.1 對Ac的改進(jìn) Ac是一段長約為4.5kb的DNA片段,人為將其末端轉(zhuǎn)位必須的一段DNA序列切除后,它就不能再借助于轉(zhuǎn)位酶進(jìn)行轉(zhuǎn)位,但仍能正常編碼轉(zhuǎn)位酶,這種修飾后的Ac稱為穩(wěn)定的Ac(StableAc,sAc)。sAc產(chǎn)生的轉(zhuǎn)位酶量可由放在轉(zhuǎn)位酶基因之前的啟動子控制,從而控制Ds在基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)位頻率。如果用Ac本身的啟動子,其作用較弱,產(chǎn)生的轉(zhuǎn)位酶少,Ds轉(zhuǎn)座的頻率較低,轉(zhuǎn)變產(chǎn)生的突變就比較穩(wěn)定。如果用強(qiáng)啟動子,則轉(zhuǎn)位酶活力高,Ds轉(zhuǎn)位頻繁,產(chǎn)生的變異頻率較高。同時為了篩選sAc的轉(zhuǎn)化株還需要在Ac上克隆一個標(biāo)記基因。用于sAc/Ds雙系統(tǒng)法中sAc的構(gòu)建方法略。 
3.2 對Ds的改進(jìn) 對Ds改進(jìn)的目的有兩個:第1,能方便地檢測Ds是否已經(jīng)從原位置轉(zhuǎn)座;第2,能檢測到Ds是否已轉(zhuǎn)移到基因組的另一個位置。改進(jìn)的方法是首先將Ds克隆到一個標(biāo)記基因的啟動子和密碼子之間,這樣可以通過篩選對抗生素的抗性來檢測Ds是否已經(jīng)轉(zhuǎn)座。另外在不影響Ds轉(zhuǎn)座能力的前提下,在Ds的DNA序列中間克隆上另一個標(biāo)記基因,這個基因?qū)⑴cDs一起轉(zhuǎn)座,這樣就可以篩選對這一基因的抗性來檢測Ds是否已經(jīng)轉(zhuǎn)座和轉(zhuǎn)座的位置。 
3.3 sAc/Ds雙系統(tǒng)法克隆基因的原因及步驟 
1)將sAc和Ds分別與T-DNA連接,在農(nóng)桿菌的幫助下分別轉(zhuǎn)入植物中,獲得sAc的轉(zhuǎn)化植株和Ds的轉(zhuǎn)化植株。 2)將sAc轉(zhuǎn)化株與Ds轉(zhuǎn)化株雜交,挑選同時含有sAc和Ds的子一代植株。 
3)雜合植株中,Ds在sAc產(chǎn)生的轉(zhuǎn)位酶幫助下轉(zhuǎn)座,引起某個基因突變,從而產(chǎn)生表型突變株。 
4)通過突變植株的自交和回交,選擇僅含有Ds而無sAc的植株,從而使變異得到穩(wěn)定。建立對應(yīng)于變異株的基因文庫或cDNA文庫。 
5)用IPCR的方法擴(kuò)增與Ds相鄰的DNA片段,利用此片段作探針直接從基因文庫或cDNA文庫中篩選對應(yīng)的基因克隆,通過DNA測序和比較了解該基因的特征。 
6)穩(wěn)定的變異株再與sAc轉(zhuǎn)化株雜交,使得Ds再次轉(zhuǎn)位,使突變的基因得到恢復(fù),從而得到回復(fù)突變株,用于檢驗(yàn)所得到的基因是否對應(yīng)于變異的基因。 
4 sAc/Ds雙系統(tǒng)法的應(yīng)用 
用sAc/Ds雙系統(tǒng)法克隆基因,容易得到回復(fù)突變株和容易產(chǎn)生再次突變克隆其它基因,與T-DNA做基因標(biāo)簽相比省去了再次轉(zhuǎn)化的繁瑣程序,為克隆基因的工作帶來了極大方便。 
理論上用sAc/Ds雙系統(tǒng)法克隆基因如果有足夠的轉(zhuǎn)化株,能克隆到任何一個基因,另外這種方法還可用于定點(diǎn)突變。如果對某一基因我們不知道它的表達(dá)產(chǎn)物,也不知道它何時在何部位表達(dá),sAc/Ds雙系統(tǒng)法是一種較好的克隆基因的方法,該方法以其*的優(yōu)點(diǎn)在克隆基因工作中將得到更廣泛的應(yīng)用。

ELISA試劑盒

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